由Cyvirus cyprinidallo3感染的普通鱼脑细胞在允许和不允许的温度下获得的微RNA表达数据
Olivier Rué1,2, Nurul Novelia Fuandila3, Saliha Hammoumi3
1Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, Jouy-en-Josas, France.
Data in brief
|July 17, 2025
概括
这项研究在感染CyHV-3的鱼细胞中确定了81种病毒微RNA (miRNA),在不同温度下监测表达动力学. 病毒miRNA表达在22°C时增加,与细胞溶解相关,但在30°C时没有增加.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子生物学分子生物学
- 水产养殖是水产养殖的一种方式.
背景情况:
- 微RNA (miRNA) 是小型非编码RNA,可以调节基因表达.
- 病毒,特别是Herpesvirales序列中的病毒,编码影响宿主病毒相互作用的miRNA.
- 类疹病毒3 (CyHV-3) 显著影响普通鱼和鱼水产养殖.
研究的目的:
- 为了识别Cyprinid疹病毒3 (CyHV-3) 在其溶解周期期间编码的微RNA (miRNAs).
- 在允许 (22°C) 和非允许 (30°C) 温度下分析这些病毒miRNA的表达动力学.
- 研究病毒miRNA表达和CyHV-3感染鱼细胞中的细胞病变效应之间的相关性.
主要方法:
- 下一代测序用于识别 CyHV-3 感染的鱼细胞中的假定预微RNA.
- 测序对齐与CyHV-3和Cyprinus carpio参考基因组相对应.
- 在感染后1小时至10天的时间内,在22°C和30°C下监测病毒miRNA的表达.
主要成果:
- 鉴定了81种由CyHV-3编码的假定miRNAs,包括7种以前报告的miRNAs.
- 病毒miRNA表达在22°C时呈现一致的增加,感染后6天达到峰值,与观察到的细胞病变效应和细胞解离相吻合.
- 在30°C时没有观察到显著的病毒miRNA表达变化或细胞病变效应.
结论:
- 这项研究提供了第一个详细的表达动力学预测CyHV-3miRNAs在受感染的鱼细胞.
- 病毒miRNA的表达取决于温度,与CyHV-3的溶液周期和细胞病变效应相关.
- 这些发现有助于了解CyHV-3的病原体,并为水产养殖业的疾病管理提供潜在的目标.
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