实际种群大小不能解释动物基因组大小和可移植元素含量的长期变化
Alba Marino1, Gautier Debaecker2, Anna-Sophie Fiston-Lavier1,3
1ISEM, Université de Montpellier, CNRS, IRD, Montpellier, France.
遗传漂移不会驱动动物的基因组大小进化. 可转移元素 (TE) 是关键驱动因素,但它们的积累是特定于血统的,与有效种群大小 (Nee) 无关.
科学领域:
- 进化生物学 进化生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 人口遗传学 人口遗传学
背景情况:
- 动物基因组大小差异很大,进化驱动因素仍在争论中.
- 突变危险假设将有效种群大小 (Nee) 与通过可转移元素 (TE) 积累的基因组大小联系起来.
- 之前的研究提供了相互矛盾的证据,阻碍了对假设的一般验证.
研究的目的:
- 研究有效种群大小 (Nee),可转移元素 (TE) 含量和不同动物系的基因组大小变异之间的关系.
- 测试突变危险假设,使用Nee和大规模基因组数据的强大代理.
主要方法:
- 分析了基因组大小,TE含量和非同义到同义替代率 (dN/dS),作为807种动物中Nee的代理.
- 作为额外的Nee代理,纳入了生命历史特征.
- 采用了类遗传学比较方法来解释进化关系.
主要成果:
- 可转移元素 (TE) 已被证实是对基因组大小变异的主要贡献者.
- 生命史特征和dN/dS率作为有效人口大小 (Nee) 的可靠代理.
- 没有证据支持增加的遗传漂移导致TE在动物之间积累;关联是微弱的和血统特定的.
结论:
- 遗传漂移并不是影响长期动物基因组大小演变的主要因素.
- 可转移元素 (TE) 动态受到血统特定因素的影响,而不仅仅是有效人口规模 (Nee).
- 基因组精简并不是通过在高Nee系中强有力的对TEs的选择来实现的.
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