在全基因组无细胞胎儿DNA查中对热囊细胞马赛克的数字估计的诊断价值

科学领域:

• 遗传学 遗传学是一种遗传学.
• 产前诊断 在产前诊断
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 无细胞胎儿DNA (cffDNA) 查为常见的三症提供了高灵敏度,但可以为其他异常产生假阳性.
• 全基因组cffDNA测定检测到额外的染色体异常,导致焦虑增加和侵入性手术,如乳液切割.
• 在cffDNA查中评估方法来区分真阳性和假阳性,对于准确的产前诊断至关重要.

研究的目的:

• 在识别错误阳性cffDNA查中评估热囊细胞马赛克数字估计的诊断价值.
• 确定这些数字估计是否可以为测试后的咨询提供信息,并减少不必要的侵入性测试.
• 分析生物信息学管道的性能与商业cffDNA测定一起.

主要方法:

• 总共有32,175个怀孕被选使用全基因组cffDNA测定和开源生物信息学管道.
• 羊膜切割结果被用来计算各种形形状的积极预测值 (PPVs),包括常见的三症,性染色体形状 (SCA),罕见的自体三症 (RATs) 和亚染色体变异 (SA).
• 进行了接收器操作特征和回归分析,以确定最小化错误阳性率 (FPR) 的指标.

主要成果:

• 该cffDNA测定显示了三症21,18和13的100%灵敏度,PPVs在17%至75%之间.
• 对于SCA,PPV从50%到89%不等,而对于SA则为37%. 在RAT中,PPV为6.6%.
• 数字估计的热质马赛克 (马赛克比率) 在识别假阳性时显示出强的表现 (AUC 0.83-0.95);在64%的RAT中看到的比率低于0.50,从来没有与胎儿形相关.

结论:

• 对于改善cffDNA查中测试后咨询,对热囊细胞马赛克的数字估计具有临床意义.
• 实施这些估计可能会从0.33%降低到0.11%的罕见自体三位症的侵入性检测率.
• 这种方法有助于区分真正的胎儿动脉增生病与潜在的假阳性,优化产前护理途径.