基于机器学习和单细胞测序数据的动脉样硬化中的铁和细胞衰老相关生物标志物的综合分析
Xiang Qi1, Shan Cao2, Jian Chen1
1Traditional Chinese Medicine (Zhong Jing) College, Henan University of Chinese Medicine, Zhengzhou, Henan, People's Republic of China.
Journal of inflammation research
|July 21, 2025
概括
这项研究确定IL1B和CCL4是关键基因,将铁和动脉样硬化中的细胞衰老联系在一起,为这种慢性炎症疾病提供了潜在的诊断生物标志物.
科学领域:
- 心血管生物学 心血管生物学
- 分子医学是分子医学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 动脉样硬化是一种由脂质积累驱动的慢性炎症性疾病.
- 铁和细胞衰老在动脉样硬化病原体中的作用尚未完全理解.
研究的目的:
- 使用生物信息学识别与动脉样硬化中的铁和细胞衰老相关的基因.
- 定义分子亚型并确定动脉样硬化的诊断生物标志物.
主要方法:
- 利用生物信息学分析动脉样硬化基因表达数据集.
- 鉴定了差异表达基因 (DEGs),并将它们与铁和衰老相关的基因交叉.
- 应用共识聚类,机器学习和单细胞RNA-seq用于亚型和生物标志物发现.
主要成果:
- 确定了23个常见的基因 (CF-DEGs),并定义了两种动脉样硬化的分子亚型.
- 在免疫细胞透和生物功能方面发现了显著的差异,包括脂肪酸代谢和炎症.
- 确定IL1B和CCL4作为枢纽基因,在动物模型中得到验证,并与单细胞-巨细胞过渡相关.
结论:
- IL1B和CCL4是动脉样硬化的潜在诊断生物标志物,与铁和衰老有关.
- 这些发现为动脉样硬化机制和诊断提供了新的见解.
