完整的受感染细胞的结构性宿主病毒互动组概况
Boris Bogdanow1,2, Lars Mühlberg3,4, Iris Gruska5
1Research group "Structural Interactomics", Leibniz Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie, Berlin, Germany. boris.bogdanow@charite.de.
Nature communications
|July 21, 2025
概括
这项研究引入了一种新的方法,用于在感染细胞中绘制病毒-宿主蛋白-蛋白相互作用 (PPI). 它揭示了数百种以前未知的相互作用,这些相互作用对于理解病毒感染至关重要.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子生物学分子生物学
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 病毒-宿主蛋白-蛋白相互作用 (PPI) 对于病毒病原性至关重要.
- 在高分辨率的原生细胞环境中识别这些相互作用仍然具有挑战性.
研究的目的:
- 开发和应用一种新的方法,用于在完整的感染细胞中高分辨率地图化病毒宿主结构互动体.
- 为了深入了解简单疹病毒1 (HSV-1) 与人类细胞相互作用的分子决定因素.
主要方法:
- 结合细胞内交联质谱与选择性丰富新合成的病毒蛋白.
- 应用结构性宿主病毒互动形分析 (SHVIP) 给生产性感染的人类细胞.
- 集成的SHVIP数据与基于AlphaFold的结构建模.
主要成果:
- 根据感染细胞内的6194个交叉链接,确定了739个病毒宿主PPI.
- 绘制了细胞内区间和宿主内膜系统之间的相互作用.
- 解决了PPI到蛋白质域水平,并在结构化和无序区域预测了相互作用地点.
- 捕获了传统蛋白质组学所错过的病毒与宿主相互作用.
结论:
- SHVIP为HSV-1感染细胞的结构互动组提供了前所未有的洞察力.
- 该方法成功地在它们的原生细胞环境中识别出真正的病毒宿主PPI.
- SHVIP数据增强了结构建模,有助于理解病毒感染机制.
