通过虚拟屏幕识别出基于β-乳酸的强效铁酸-DNA二酶1抑制剂
Xue Zhi Zhao1, Wenjie Wang2, Kiall F Suazo3,4
1Chemical Biology Laboratory, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Frederick, MD, USA. xuezhi.zhao@nih.gov.
我们选了DrugBank的分子,以准氨基-DNA二酶1 (TDP1). 几种β-乳酸显示出抑制潜力,而素C显示出单位微分子功效,这表明了一个新的治疗设计平台.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 药用化学 医学化学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 铁-DNA二酶1 (TDP1) 是一个重要的治疗点.
- 之前的研究显示,TDP1的催化口袋内通过与HKN基因的键与小分子结合.
研究的目的:
- 为了虚拟选DrugBank的TDP1抑制剂.
- 探索β-乳酸盐作为TDP1向药物设计的潜在支架.
主要方法:
- 使用MolSoft ICM Pro. 进行DrugBank 5.0的虚拟选.
- 在体外抑制测定 (光催化) 的选择β-lactams.
- 评估一个β-lactam抗生素库.
- 分子对接和表面等离子体共振 (SPR) 分析.
主要成果:
- 虚拟查确定了具有TDP1.1有利结合分数的β-乳酸盐.
- 几种β-乳酸盐在体外显示微分子TDP1抑制.
- 氨酸C显示了单位微分子IC50值,并在催化和DNA基质结合部位内对接.
- SPR证实了类素C的非共价结合模式.
结论:
- β-乳酸盐是一种有前途的新型TDP1抑制剂.
- 可以优化β-乳支架以准TDP1的催化口袋和DNA结合通道.
- 这项研究为开发基于TDP1的新型治疗方法提供了基础.
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