叶卷曲病毒的跨物种传播和重组动态:对宿主范围扩张和基于LAMP的检测的影响

科学领域:

• 植物病毒学 植物病毒学
• 分子生物学分子生物学
• 农业科学 农业科学

背景情况:

• 贝戈莫病毒是重要的植物病原体,在全球造成大量作物损失.
• 之前的研究主要集中在主要作物中的贝戈莫病毒感染,关于它们在各种植物物种中的流行情况的信息有限.

研究的目的:

• 在印度卡纳塔克州,在十种不同表现出疾病症状的植物物种中识别和描述贝戈莫病毒感染.
• 开发用于检测贝戈莫病毒的快速诊断工具.

主要方法:

• 完整病毒基因组和相关贝塔卫星的PCR放大和测序.
• 序列分析 (SDT,RDP) 用于确定病毒身份和检测重组.
• 开发和验证循环介导同热放大 (LAMP) 试验.

主要成果:

• 叶曲线病毒 (ChLCuV),叶曲线艾哈迈达巴德病毒 (ChLCuAV) 和叶曲线印度病毒 (ChLCINV) 的完整基因组,以及贝塔卫星,在,黄,,尼姆,达图拉,杜兰特,奇迹,佩迪兰修斯,海利克里索姆和子中被确定.
• 序列分析揭示了不同的核酸身份和显著的重组事件,表明病毒通过遗传交换进化.
• 开发的LAMP试验成功检测了所有十种宿主物种中的贝戈莫病毒感染.

结论:

• 这项研究首次报告了印度十种不同的植物物种受到ChLCuV,ChLCuAV,ChLCINV和贝塔卫星的感染.
• 感染这些宿主的贝戈莫病毒很可能是通过与先前存在的病毒重组而演变的.
• LAMP测试是快速,现场水平的贝戈莫病毒诊断的一个有前途的工具.