整合肺和全身转录组,以鉴定儿科造血干细胞移植后的肺损伤

科学领域:

• 免疫学和血液学 免疫学和血液学
• 基因组学和转录基因组学
• 肺部医学 肺部医学

背景情况:

• 造血干细胞移植 (HCT) 是一种关键的治疗方法,但肺损伤仍然是一个重大并发症.
• 支气管洗 (BAL) 转录组可以识别肺损伤并预测HCT后的死亡率.
• 外周血液作为BAL替代品在评估HCT相关的肺损伤中的实用性尚不清楚.

研究的目的:

• 为了确定外围血液转录组是否可以作为儿科HCT患者BAL转录组的替代品.
• 在HCT接受者中比较BAL和外周血液之间的转录形状.
• 调查BAL和血液转录组所提供的关于肺损伤的独特和互补信息.

主要方法:

• 对比了来自27家医院的166名儿科HCT患者的210个配对的BAL和外周血液转录组.
• 对基因表达的分析,基因组的丰富,归因细胞分数和T细胞和B细胞受体克隆类型的分析.
• 结合配对的转录组来识别患者亚组,并与临床结果相关联.

主要成果:

• 在基因,途径,细胞分数和克隆型水平上观察到BAL和血液RNA丰度之间的最小相关性.
• 鉴定出了不同的转录程序:BAL显示了与死亡相关的免疫,缺氧和上皮-介质细胞过渡途径;血液显示了与死亡相关的内皮损伤,DNA修复和代谢途径.
• 综合分析将患者分为两组,具有显著不同的缺氧率和短期临床结果.

结论:

• 周围血液转录组在评估与HCT相关的肺损伤时不是BAL转录组的直接替代品.
• BAL和血液转录组捕捉了细分损伤反应,为当地肺和全身影响提供了独特的见解.
• 结合BAL和血液转录组数据,提供了补充信息,以全面了解HCT后肺损伤机制和患者分层.