在结直肠癌中检测瘤性融合,使用伴侣不可知的下一代测序方法
Andrew J Pellatt1, Reagan M Barnett2, Sante Gnerre2
1Intermountain Health, Salt Lake City, USA. apellatt11@gmail.com.
BMC cancer
|July 22, 2025
概括
伴侣不可知性ctDNA测试在1.3%的晚期结直肠癌 (CRC) 患者中发现了基因融合. 检测这些融合,特别是亚克隆的融合,可以指导向治疗,并揭示对EGFR抑制剂的耐药性机制.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子诊断学 分子诊断
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 在结直肠癌 (CRC) 中很少发现基因融合.
- 在晚期CRC中融合测试的临床意义尚不清楚.
- 识别致癌融合对于理解晚期CRC进展至关重要.
研究的目的:
- 在晚期结直肠癌 (CRC) 患者中识别致癌基因融合.
- 通过对象不可知循环瘤DNA (ctDNA) 测试来评估融合检测的临床相关性.
- 探索融合与微卫星不稳定性高 (MSI-H) 状态和EGFR导向治疗特征的关联.
主要方法:
- 对18558名晚期CRC患者ctDNA下一代测序数据 (2017-2022) 的回顾性分析.
- 使用合作伙伴不可知生物信息学方法对样本进行重新分析,以检测克隆和非克隆融合.
- 统计分析融合患病率和与MSI-H状态和先前EGFR治疗的关联.
主要成果:
- 在1.3% (221/18,558) 的晚期CRC患者中检测到基因融合.
- 在193名患者中发现了激活融合,其中7%是克隆性,93%是亚克隆性.
- 克隆融合在MSI-H患者中更为普遍;亚克隆融合与之前的EGFR治疗相关.
结论:
- 伴侣不可知ctDNA融合检测是一种可行的基于血液的方法,用于先进的CRC.
- 通过ctDNA进行融合检测可以根据克隆性告知潜在的治疗策略.
- 亚克隆融合可能表明特定CRC亚型对EGFR抑制剂的获得性耐药性.


