在Xanthomonas phaseoli pv.期间,最佳的参考基因选择和潜在的目标基因识别. 死亡细菌 - - 安都安德里安的感染

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 克桑托蒙纳斯 (Xanthomonas) 草植物植物 (phaseoli pv. 迪芬巴基菌 (Xpd) 在EPPO A2隔离生物体Anthurium中引起细菌病变.
• 尽管进行了Xpd全基因组测序,但人类菌病 (ABB) 的分子机制基本上是未知的.

研究的目的:

• 在早期Xpd-Anthurium相互作用期间识别稳定的参考基因以进行准确的基因表达分析.
• 用RT-qPCR和统计方法验证候选参考基因.

主要方法:

• 使用BestKeeper,geNorm和delta Ct (ΔCt) 方法评估了四个参考基因 (rpoD,gyrB,atpD,thyA) 的稳定性.
• 在敏感的Anthurium andreanum品种"Marian Seefurth"上使用逆转录定量PCR (RT-qPCR) 在多个时间点 (0,0.5,1,2小时).
• 通过将四个与致病性相关的基因的表达正常化,验证了参考基因的适应性.

主要成果:

• rpoD 和 gyrB 显示出最稳定的表达特征.
• 在Xpd-Anthurium相互作用期间,atpD和thyA的表达不太稳定.
• 在1小时后,编码赞坦生物合成甘氨酸转移酶的gumD高度上调,这表明它在毒性方面发挥了关键作用.

结论:

• rpoD和gyrB是Xpd-Anthurium病理系统中基因表达研究的合适参考基因.
• 确定稳定的参考基因将使ABB分子机制的更准确的研究成为可能.
• D的上调表明它作为这种病理系统中的潜在毒性决定因素的重要性.