在树中核酸结合性白丰富的重复基因家族的全基因组识别和表达分析
Xianbao Liu1, Huiqing Xu2, Boxun Li3
1Environment and Plant Protection Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences (CATAS), Haikou, Hainan, China; liuxianbao2013@126.com.
Phytopathology
|July 23, 2025
概括
研究人员在树中确定了253个核酸结合和丰富氨酸的重复 (NLR) 基因,发现了两种与抗炭素耐药性相关的特定NLR基因. 这一发现有助于开发树的新抗性标记物.
科学领域:
- 植物遗传学 植物遗传学
- 分子生物学分子生物学
- 植物病理学 植物病理学
背景情况:
- 由 *Colletotrichum* spp. 引起的炭病,对树构成了全球重大威胁.
- 核酸结合和富含白的重复蛋白 (NLR) 是关键的植物免疫受体,但它们在树抗人类毒素抵抗中的作用尚不清楚.
研究的目的:
- 在野生树基因组中全面识别NLR基因家族成员.
- 为了研究NLR基因与树中人毒耐药性之间的关系.
- 为了确定与对标记器辅助繁殖的耐药性相关的特定NLR基因.
主要方法:
- 在树生殖质中全基因组识别NLR蛋白 MT/VB/25A 57/8.8.
- 生物信息分析包括保存型号识别和染色体映射.
- 进行比较转录组和定量RT-PCR分析,以评估对*Colletotrichum siamense*感染的反应中的基因表达.
主要成果:
- 确定了253个NLR家族成员,包括155个卷轴NLR (CNL) 和35个Toll / 介质素-1受体NLR (TNL) 蛋白质.
- CNL和TNL基因主要位于染色体1,3,8,12和14上,并联重复是基因家族扩张的主要驱动因素.
- 发现两个CNL基因 (*LOC110667987*和 *LOC110668014*) 在耐药生殖质中被优先表达,并在真菌感染时被上调.
结论:
- 该研究提供了树中NLR基因的全面目录,提供了对它们的演变和分布的见解.
- 鉴定了特定的CNL基因,这些基因在树对毒素的防御中起着至关重要的作用.
- 这些发现有助于开发分子标记物,以增强树繁殖计划中的抗甲基耐药性.
