在基因组组合的染色体水平上,Qihe gibel鱼的基因组组合
Kaiqi Lian1,2,3, Jinyan Shan1,3,4, Jun Ma1,3
1School of Biotechnology and Food Science, Anyang Institute of Technology, Anyang, 455000, China.
Scientific data
|July 24, 2025
概括
使用先进的测序技术组装了Qihe gibel的高质量染色体级基因组. 这种基因组资源将支持未来的分子育种研究和对这种有价值的鱼类物种的进化研究.
科学领域:
- 水产养殖和基因组学
- 鱼类生物学和遗传学 鱼类生物学和遗传学
背景情况:
- 吉贝尔鱼 (Carassius gibelio var. 这种鱼的鱼类有很多种. ) 是一种有价值的天然妇产遗传双胞胎资源.
- 了解它的基因组对于它的保护和繁殖至关重要.
研究的目的:
- 组装一个高质量的染色体水平基因组的Qihe gibel鱼.
- 为未来的研究和育种提供基础资源.
主要方法:
- 使用了DNBSEQ,PacBio HiFi和Hi-C测序技术.
- 组装了一个1.607Gb的基因组,有350个连接.
- 将96.21%的基因组固定在50个染色体上.
主要成果:
- 实现了28.97 Mb的contig N50和29.84 Mb的脚手架N50.
- 确定了重复序列 (43.72%) 和46,131个编码蛋白质的基因 (96.48%的注释).
- 已经证明了高基因组完整性 (97.66%的BUSCO评分).
结论:
- 一个高质量的染色体水平基因组组装Qihe吉贝尔鱼已经成功生成.
- 这种基因组为分子生物学,育种和进化研究提供了关键资源.
- 促进了海研究和水产养殖的未来进展.


