来自选采样管的便微生物群尽管采样和储存条件不同,但稳定
Anders Bech Jørgensen1, Louise Almer2, Birgitte Brandstrup3
1Department of Surgery, Part of Copenhagen University Hospitals - Holbaek, Smedelundsgade 60, Holbaek, 4300, Denmark. dr.bech@gmail.com.
Scientific reports
|July 24, 2025
概括
便免疫化学试验 (FIT) 管可用于大规模的肠道微生物组研究. 尽管处理和储存条件各异,但FIT样本中的微生物组仍然强大且具有代表性.
科学领域:
- 微生物组研究的研究.
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 便免疫化学测试 (FIT) 套件被广泛用于结直肠癌查.
- 剩余的FIT样本为大规模肠道微生物组研究提供了潜在的资源.
- 测序的进步允许进行全长的细菌16S核糖体基因分析.
研究的目的:
- 评估分析前处理和储存条件对FIT样本微生物组概况的影响.
- 评估FIT管中保存的肠道微生物组的稳定性和代表性.
主要方法:
- 从八名健康成年人的便样本被存储在各种条件下 (+20°C,-18°C,-80°C) 持续时间不同.
- 提取了DNA,并使用牛津纳米孔技术测序了全长的16SrRNA基因片.
- 分析了微生物组的组成,考虑了采样变化和缓冲存在.
主要成果:
- 微生物群的丰富性,香农的多样性和个体特征在不同条件下在很大程度上得到了保留.
- 观察到微小的变化,包括在+20°C保存4-10天的样本中产生原酶的细菌增加.
- 尽管没有监督的采样和储存,便微生物组仍然具有代表性和稳健性.
结论:
- FIT样本是大规模肠道微生物组研究的可行和强大的资源.
- 在FIT样本的分析前处理变化对整体微生物组概况产生最小的影响.
- 这些发现支持在人口层面的微生物组研究中使用FIT收集的样本.


