通过复合相似网络辅助代谢学分析研究结性脊柱炎的代谢途径
Jinxia Hu1,2, Xuean Wang3, Hailiang Li1,2
1Key Laboratory of Green Chemistry & Technology of Ministry of Education, College of Chemistry, Sichuan University, Chengdu 610064, Sichuan, China.
Analytical chemistry
|July 25, 2025
概括
这项研究引入了一种新的化合物相似性网络 (CSN) 策略,用于识别疾病中的关键代谢物和代谢途径. 该方法被应用于结性脊髓炎 (AS),揭示了潜在的棕酸途径参与AS病变.
科学领域:
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 系统生物学 系统生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 基于液体染色学-质谱学 (LC-MS) 的代谢学为分析疾病机制提供了高灵敏度.
- 识别与疾病相关的代谢物及其途径至关重要,但与传统的统计方法具有挑战性.
- 目前的方法往往无法发现代谢物在疾病进展中的生物途径.
研究的目的:
- 开发一种新的化合物相似性网络 (CSN) 辅助策略,用于疾病中的定量代谢物分析.
- 通过整合与代谢反应模板的结构相似性来探索调节疾病的代谢途径.
- 应用这一策略来确定结性脊柱炎 (AS) 中的关键代谢物和途径.
主要方法:
- 开发了一种CSN辅助的数据挖掘策略,用于代谢物分析.
- 利用基于结构相似性的光谱独立化合物聚类.
- 集成的KEGG和RetroRules代谢反应模板来探索路径.
- 将该策略应用于来自AS,健康和类风湿关节炎 (RA) 队列的代谢学数据.
主要成果:
- 在CSN的协助下,该战略成功地确定了关键代谢物和潜在的疾病调节途径.
- 为AS构建了一个特定的棕酸代谢途径.
- 该研究提供了一种新的方法来剖析疾病中的复杂代谢变化.
结论:
- 该CSN辅助的代谢学策略是有效的识别疾病相关的代谢物和途径.
- 棕酸通路可能在结性脊髓炎的发病过程中发挥调节作用.
- 这种方法提高了对类风湿性疾病分子机制的理解.
