鼠标肝细胞AML12暴露于酸的RNA-Seq分析
Ning Wang1, Jing Leng1, Yaxin Han2
1Institute of Chemical Toxicity Testing, NHC Specialty Laboratory of Food Safety Risk Assessment and Standard Development, State Environmental Protection Key Laboratory of Environmental Health Impact Assessment of Emerging Contaminants, Shanghai Municipal Center for Disease Control and Prevention, Shanghai 201701, China.
Toxics
|July 25, 2025
概括
尼奥酸暴露会通过改变铁亡途径导致肝损伤. 非编码RNAs (ncRNAs) 在这种Nd(NO3) 3诱导的肝毒性中发挥着关键作用,提供了潜在的生物标志物.
科学领域:
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 酸 (Nd ((NO3) 3) 是一种在全球范围内使用的化合物,工作和环境安全问题越来越严重.
- 暴露于 Nd ((NO3) 3 可能导致器官积累和毒性,包括潜在的肝毒性.
- 非编码RNAs (ncRNAs) 在Nd(NO3) 3诱导的肝损伤中的特定作用尚不清楚.
研究的目的:
- 为了研究 Nd(NO3) 3 诱导的肝损伤背后的分子机制.
- 为了确定关键的基因,调节途径,和参与Nd(NO3) 3肝毒性的非编码RNA.
- 建立一个全面的转录基因数据库,用于 Nd(NO3) 3 诱导的肝损伤.
主要方法:
- 对小鼠肝细胞 (AML12细胞) 暴露于 Nd(NO3) 3.3.
- RNA测序 (RNA-seq) 用于分析mRNA,miRNA,lncRNA和circRNA的表达特征.
- 定量PCR (qPCR) 用于验证,以及基因本体学 (GO) 和KEGG途径分析用于差异性基因表达.
主要成果:
- Nd(NO3) 3暴露显著改变了与铁亡相关的基因的表达.
- RNA-seq显示了mRNA,miRNA,lncRNA和circRNA表达的实质性变化.
- GO和KEGG分析表明,差异表达的基因和细胞铁亡途径之间存在强烈的关联. 特定的ncRNAs被上调.
结论:
- 这项研究提供了第一个全面的转录组数据 Nd ((NO3) 3 诱导的肝损伤.
- 非编码RNA涉及到由Nd(NO3)3.3.引起的肝毒性.
- 这些发现提供了对Nd(NO3) 3诱导的肝损伤机制的洞察力,并表明了ferroptosis和肝损伤的潜在生物标志物.
