猪样品类型特征与流感A病毒的测序和分离相关
Daniel C A Moraes1, Onyekachukwu H Osemeke1, Michael A Zeller1
1Department of Veterinary Diagnostic and Production Animal Medicine, College of Veterinary Medicine, Iowa State University, Ames, IA 50011, USA.
Veterinary sciences
|July 25, 2025
概括
猪流感A型病毒 (IAV) 的测序和分离是最成功的使用鼻和肺组织. 口服液可以有效地对IAV基因测序具有较低的RT-rtPCRCt值,改善猪监测.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 动物健康监督 动物健康监督
背景情况:
- 在猪群中进行A型流感病毒 (IAV) 监测对于公众和动物健康至关重要.
- 优化诊断试验的灵敏度和特异性对于有效检测和控制猪的IAV至关重要.
- 了解样本类型对IAV测序和隔离工具的影响,有助于完善诊断和监测策略.
研究的目的:
- 评估IAV血凝素 (HA) 和神经氨基酶 (NA) 的成功概率,在不同类型的猪样本中进行桑格尔测序和病毒隔离.
- 为了确定反转录实时聚合酶连锁反应 (RT-rtPCR) 周期值 (Ct) 与 95%,75% 和 50% 的顺序和隔离成功概率相关的值.
- 为改善猪群IAV诊断测试和监测提供数据驱动的见解.
主要方法:
- 对从2018年到2024年提交给爱荷华州立大学兽医诊断实验室 (ISU VDL) 的死前和死后猪样本的分析.
- RT-rtPCR Ct值与IAV HA和NA桑格测序成功以及Madin-Darby犬 (MDCK) 细胞中的病毒隔离的相关性.
- 确定每个样本类型的成功结果的特定概率 (95%,75%,50%) 的Ct值.
主要成果:
- 鼻和肺组织显示IAV基因测序和病毒隔离成功的可能性最高.
- 口服液体显示了IAV基因测序成功的潜力,具有较低的RT-rtPCR Ct值 (≤27.3).
- 特定的Ct值被确定为95%的成功概率:HA测序 (鼻抽样:27.8,口腔液体:27.3),NA测序 (鼻抽样:23.6,口腔液体:22.1),和病毒隔离 (鼻抽样:21.1,肺组织:18.7).
结论:
- 鼻和肺组织是最大限度地提高猪IAV测序和隔离成功的最佳样本类型.
- 当RT-rtPCR Ct值较低时,口服液为IAV基因测序提供了一个可行的,有利于福利的替代方案.
- 该研究为解释诊断结果和优化猪IAV监测策略提供了实际的基准.
