协议更新:用于从小鼠大脑和胰腺器官中单细胞的多组学分析的高通量scNMT协议

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 神经科学是一个神经科学.

背景情况:

• 单细胞多组学分析使得我们能够深入了解生物.
• 单细胞核细胞,甲基组和转录组 (scNMT) 测序的现有方法在吞吐量和数据产量方面存在局限性.

研究的目的:

• 描述一个更新的scNMT测序协议,用于单细胞的高通量,多组学分析.
• 通过微型反应和先进的协议,提高每个细胞的基因和CpG位点的检测.

主要方法:

• 对小鼠大脑和胰腺器官进行scNMT测序的调整.
• 实施液体处理平台,以实现384井板格式的可扩展性.
• 集成Smart-seq3协议和反应体积小型化.

主要成果:

• 从96口井增加到384口井的吞吐量.
• 每个细胞中检测到的基因和基因组DNA (gDNA) CpG的数量越来越多.
• 建立了正常化策略,以实现最佳的每细胞测序深度分布.

结论:

• 更新后的scNMT协议为单细胞多组学研究提供了一种强大且可扩展的方法.
• 这一进步促进了复杂生物系统中细胞异质性的更全面的分析.