在持续的STAT3相关染色体构造中协调基因表达有助于肝细胞癌进展

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.

背景情况:

• 化信号转换器和转录3激活器 (p-STAT3) 是肝细胞癌 (HCC) 进展的关键驱动因素.
• 对于p-STAT3在3D染色体构造中的作用及其对HCC相关基因表达的影响尚不清楚.

研究的目的:

• 在HCC.中通过持续的STAT3激活调节的3D染色体构造的识别.
• 验证p-STAT3.3驱动的HCC攻击性的基础分子机制.

主要方法:

• 对具有不同STAT3激活水平的HCC细胞系进行比较分析.
• 在p-STAT3和H3K27ac.ac.中进行染色体免疫沉测序 (ChIP-seq).
• 高通量染色体形状捕获技术 (Hi-C,HiChIP).
• RNA测序和功能测试 (入侵,管形成).

主要成果:

• 持续的p-STAT3激活与HCC预后不佳相关,并在3D基因组中形成频繁相互作用区域 (FIREs).
• 在p-STAT3相关的FIRE中的基因表现出协调的表达,促进HCC入侵和管道形成.
• 这些FIRE改变了拓关联域 (TADs),并且尽管存在STAT3抑制,但仍然存在,从而导致耐药性.

结论:

• 持续的p-STAT3激活通过FIRE形成重塑HCC的3D染色体架构,驱动侵略性的表型.
• 与p-STAT3相关的FIREs维持基因表达,并有助于HCC的治疗耐药性.
• 针对3D染色体动态呈现出对STAT3抑制剂耐药HCC的有前途的治疗策略.