翻译效率共变确定了跨细胞类型的保存协调模式.
Yue Liu1, Shilpa Rao1, Ian Hoskins1
1Department of Molecular Biosciences, The University of Texas at Austin, Austin, TX, USA.
这项研究引入了翻译效率共变 (TEC),以揭示跨细胞协调的基因翻译模式. 在哺乳动物中保存TEC,并识别了RNA分析遗漏的基因功能,提供了新的生物技术应用.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 系统生物学 系统生物学
背景情况:
- 基因表达协调在RNA水平上得到了很好的研究,有助于调控网络的发现.
- 基因表达在翻译水平上的协调在很大程度上仍未被探索.
研究的目的:
- 调查基因表达协调是否延伸到翻译水平.
- 引入和定义翻译效率共变量 (TEC) 作为协调翻译的衡量标准.
- 探索TEC在哺乳动物中的保护和功能影响.
主要方法:
- 统一分析了来自人类和小鼠组织/细胞系的3819个核糖体分析数据集.
- 开发和应用TEC指标以确定协调翻译模式.
- 将TEC与RNA和蛋白质共同表达模式进行比较.
主要成果:
- 确定TEC作为哺乳动物转录组中保存的组织原理.
- TEC揭示了从RNA或蛋白质共同表达中不明显的基因功能.
- 物理相互作用的蛋白质在翻译和转录层面都表现出丰富的正共变性.
- 提名的候选机制驱动共享的翻译监管模式.
结论:
- 翻译效率共变 (TEC) 是哺乳动物基因表达的一个保存特征.
- TEC为了解基因功能和调节提供了一个新的框架.
- TEC具有作为预测标记物和合成生物学应用的潜力.
更多相关视频
06:33Author Spotlight: Comprehensive Epigenetic Analysis for Investigating Human Cellular Plasticity and Environmental Adaptation Using Immunofluorescence Assays
Published on: June 28, 2024
07:59Author Spotlight: Alignment of Synchronized Time-Series Data Using the Characterizing Loss of Cell Cycle Synchrony Model for Cross-Experiment Comparisons
Published on: June 9, 2023
相关概念视频
Combinatorial Gene Control
The expression of more than 30,000 genes is controlled by approximately 2000-3000 transcription factors. This is possible because a single transcription factor can recognize more than one regulatory sequence. The specificity in gene...
Coordination of Gene Expression Processes in Bacteria
Cell Specific Gene Expression
General Transcription Factors
Improving Translational Accuracy
Cooperative Binding of Transcription Regulators
