一个本质上有障碍的Ubp10区域调节了它对ubiquitinated histone基质的结合和活性
Anneliese M Faustino1, Melesse Nune2, Raquel Merino-Urteaga3,4
1Department of Chemistry, Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland, USA.
基因组H2B的无处不在对于转录至关重要. 研究人员发现Ubp10酶更喜欢自由的H2A/H2B二极体,这解释了由于结构约束而对核细胞的低活性.
科学领域:
- 表观遗传学和翻译后修改
- 分子生物学分子生物学
- 染色体动力学 染色体动力学
背景情况:
- 单双基因基因素H2B (H2Bub1) 是一种在转录过程中动态调节的过渡性表观遗传标记.
- 在酵母中,H2Bub1由Rad6/Bre1建立,并通过duebiquitinases Ubp8和Ubp10去除.
- Ubp10在H2A/H2B二次体上表现出比核子体更高的活性,这种效应是由FACT伴侣调节的.
研究的目的:
- 阐明Ubp10在H2A/H2B二元体与核子体上的差异活性的机制基础.
- 为了研究基质呈现中的基因素伴侣FACT在Ubp10.10中的作用.
- 了解控制 Ubp10 基质特异性的结构相互作用.
主要方法:
- 单分子福斯特共振能量转移 (smFRET) 实验用于观察FACT介导的DNA和核细胞组动态.
- 交叉连接质谱法 (XL-MS) 用于绘制Ubp10 - 希斯复合体内的蛋白质 - 蛋白质相互作用.
- 由交联数据指导的结构建模.
主要成果:
- 事实解开DNA并驱逐H2A/H2B二元体,这是Ubp10.0的首选基质.
- Ubp10在自由二元与核细胞相对的状态下表现出与H2A/H2B不同的相互作用概况.
- Ubp10的内在无序区域 (IDR) 在二元体中与H2A/H2B相互作用,但在核体中与H3/H4尾巴相互作用.
结论:
- 实际上,FACT通过释放其首选基质H2A/H2B二极体来促进Ubp10的活性.
- 核酶体内涉及DNA,H3和H4的固态碰撞阻止Ubp10形成与自由二次体观察到的相同的高亲和度复合物.
- 这些发现解释了Ubp10的核细胞基质偏好及其在转录中的调节.
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