循环等离子体蛋白作为免疫疗法毒性的生物标志物:从蛋白质组范围内的孟德尔随机化和生物信息学分析的见解

科学领域:

• 遗传学和免疫学 遗传学和免疫学
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 癌症治疗方法 癌症治疗方法

背景情况:

• 免疫检查点抑制剂 (ICI) 彻底改变了癌症治疗,但可能导致严重的免疫相关不良事件 (irAEs).
• 预测和缓解irrAEs对于患者的安全和治疗的继续至关重要.
• 血蛋白提供可访问的生物标志物和潜在的治疗点.

研究的目的:

• 使用多omics方法识别与irAEs因果相关的血蛋白.
• 为了阐明驱动irAE病变的BMI独立路径.
• 为了发现新的治疗目标来管理IRE.

主要方法:

• 双向双样本门德尔随机化 (MR) 整合蛋白质定量特征位置 (pQTLs) 和irAE全基因组关联数据.
• 定位,多变量MR (MVMR) 对BMI进行调整,以及调解MR以确定因果关系.
• 系统生物学方法,包括组织特异性表达和途径分析.

主要成果:

• 八种血蛋白 (例如CD40,TNFSF12) 与所有等级的IRE相关;五种 (例如ADA,CCL25) 与高等级的IRE相关.
• CD40/TNFSF12和ADA/CCL25作为治疗目标优先考虑.
• 确定了BMI独立的irAE通路,其中特定的蛋白质与器官特异性毒性有关 (例如,肺中的CSF1,TGFβ1).

结论:

• 建立了血蛋白在irAE病变发生过程中的因果图谱.
• 确定可操作的生物标志物和治疗目标,用于irAE管理.
• 通过最大限度地提高疗效,同时减轻不良事件,推进免疫疗法.