对于亚热带作物条形码的通用原料的潜力:阿克丁尼迪亚,费乔亚,类和茶叶

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 植物遗传学 植物遗传学
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 有效的生殖质管理依赖于植物基因型的准确分子识别.
• DNA 条形码为区分植物品种和管理遗传资源提供了强大的工具.
• 亚热带地区的作物,如actinidia,feijoa,果和茶,具有重要的农业和经济价值.

研究的目的:

• 评估11种通用原料对用于亚热带作物品种DNA条形码的效率.
• 为了识别多态DNA标记物,在actinidia,feijoa,类和茶叶中进行物种内歧视.
• 评估特定原料在这些作物品种中开发DNA条形码的实用性.

主要方法:

• 桑格测序被用来分析来自47种亚热带作物的DNA.
• 针对各种遗传位点的11个通用原始组对进行了放大和多态性测试.
• 单核酸多态 (SNP) 和插入/删除 (InDels) 使用高效的叶绿素原料原料被确定.

主要成果:

• 初始对trnE-UUC/trnT-GUU在所有测试的作物中表现出最高的种内多态性.
• 原始物rpl2内和16S显示出多态性最低的水平.
• 原始物23S,4.5S和5S,以及rpoC1内子对茶叶和动态生物的种内分析有效.

结论:

• 由于trnE-UUC/trnT-GUU的高多态性,推用于亚热带作物的DNA条形码.
• 特定的原料可以有效地区分茶叶,actinidia,类和feijoa中的基因型.
• 已识别的SNP和InDels为生殖细胞管理和育种计划提供了有价值的分子标记物.