针对SARS-CoV-2蛋白酶的自然化合物类型的计算评估和多标准优化
Paul Andrei Negru1,2, Andrei-Flavius Radu1,3, Ada Radu1,4
1Doctoral School of Biological and Biomedical Sciences, University of Oradea, 410087 Oradea, Romania.
Current issues in molecular biology
|July 29, 2025
概括
自然化合物通过向病毒蛋白酶提供潜在的COVID-19治疗方法. 虚拟查发现了具有强烈结合亲和力的有前途的shogaol和gingerol衍生物,支持进一步的治疗探索.
科学领域:
- 计算化学和药物发现
- 病毒学和传染病学.
- 自然产品化学 自然产品化学
背景情况:
- 由于COVID-19的流行,需要针对SARS-CoV-2主要蛋白酶 (3CLpro) 和帕帕因类蛋白酶 (PLpro) 等重要病毒蛋白的新疗法.
- 现有的治疗方法面临局限性,突出了天然化合物的免疫调节,抗炎和抗氧化特性潜力.
研究的目的:
- 实际选天然来源的化合物类似物,以有效抑制SARS-CoV-2的3CLpro和PLpro.
- 识别具有改进的结合亲和力和有利的药物动力学特征的新型治疗候选药物.
主要方法:
- 使用化学相似性算法对抗ChEMBL数据库对600多种植物化学衍生类型的综合虚拟选.
- 自动化分子对接,相互作用模式分析和选择化合物的ADMET分析.
- 使用DIGEP-Pred进行基因表达路径分析,以预测对炎症和氧化应激的影响.
主要成果:
- 几种类型的模拟器与母支架相比显示出更高的结合得分.
- CHEMBL1720210 (shogaol类似物) 与PLpro (-9.34 kcal/mol) 产生强烈的相互作用,形成关键的和疏水性键.
- CHEMBL1495225 (6-醇衍生物) 对3CLpro (-8.04 kcal/mol) 具有很高的亲和力,具有多种和疏水性相互作用.
- CHEMBL4069090被确定为一种具有有利药物相似性的化合物,并预测了PLpro结合.
结论:
- 在in silico方法中成功优先考虑了SARS-CoV-2的生物活性天然化合物类似物.
- 已识别的化合物,特别是CHEMBL1720210和CHEMBL1495225,需要对潜在的抗病毒疗法进行实验验证.
- 这项研究支持自然起源化合物的发展,作为COVID-19治疗策略中的支持剂.
关键词:
3Cl- 烯基的使用方法这就是Allium sativum.在 COVID-19 疫情中,PLpro PLpro 是一个专业的这就是SARS-CoV-2病毒.银杏树是官方的植物.在的中.分子对接的分子对接.虚拟选是虚拟的选.更多相关视频
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