在伊朗,利用RT-PCR和下一代测序对果马赛克病影响的树木进行全面的病毒谱分析

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 病毒学 病毒学
• 园艺园艺 园艺园艺

背景情况:

• 果 (Malus domestica) 是伊朗的一个重要的经济作物.
• 评估果园的健康状况对于保持生产率至关重要.
• 之前对伊朗果病毒和病毒的调查是有限的.

研究的目的:

• 综合评估伊朗果品种的卫生状况.
• 鉴定影响伊朗果树的已知和潜在的新型病毒和病毒病原体.
• 了解检测到的病原体的流行率和遗传关系.

主要方法:

• 从伊朗各地的商业品种收集了170个果叶样本.
• 针对五种常见的果病毒和两种病毒的RT-PCR查.
• 下一代测序 (NGS) 用于识别未知或新型病原体和全基因组检索.
• 精选病毒和病毒分离物的遗传学分析.

主要成果:

• 通过RT-PCR确认了六种已知的病原体的存在:ACLSV,ASPV,ASGV,AGCaV,ApMV和HSVd.
• 国家基因系统确定了三个额外的病原体:CCGaV,AHVd和AVCaV,随后通过RT-PCR确认.
• 果绿纹相关病毒 (AGCaV) 是最常见的 (47.6%),67%的样本显示混合感染.
• 遗传学分析表明伊朗分离品的共同起源.
• 在伊朗的果中首次报告了AGCaV,CCGaV,ApMV和AVCaV,在非普鲁努斯宿主中首次报告了AVCaV的全球报告.

结论:

• 这项研究提供了首次对伊朗果树卫生状况的全面评估.
• 多种病毒和病毒,包括最近报告的病毒,在伊朗的果园中是特有的.
• 混合感染的高患病率凸显了该地区果生产面临的重大威胁.