挑战和形态特征的预测价值在甲固定,嵌组织的泛真菌测序:一个5年的回顾性研究

科学领域:

• 医学真菌学 医学真菌学
• 分子诊断学 分子诊断
• 组织病理学 组织病理学

背景情况:

• 全真菌测序 (PFS) 对于在甲固定,嵌 (FFPE) 组织中识别真菌病原体非常有价值.
• 由于有限的可用性和污染风险,对于可解释的PFS结果,必须定义其病原学预测因子.

研究的目的:

• 评估基因病理特征,预测临床可解释的泛真菌测序结果.
• 评估PFS在疑似侵袭性真菌感染中的诊断效用.

主要方法:

• 五年来为PFS提交的FFPE组织样本的回顾性分析.
• 组织病理学数据的审查和评估使用Grocott methenamine银色染料的真菌元素负担.
• 组织病理学发现与PFS和可用的真菌培养数据的相关性.

主要成果:

• 在54%的具有组织学真菌元素的病例中,PFS呈阳性;只有9%的没有组织学证据的病例呈阳性 (可能的污染物).
• 特定生物体的组织病理学预测在37%的病例中导致PFS差异,可能导致低于最佳的抗真菌疗法.
• 在真菌负担和PFS检测之间没有发现相关性.

结论:

• 当真菌元素在FFPE组织中可见时,全真菌测序对属/物种识别有效.
• 在怀疑真菌感染时,PFS是一个有价值的工具,特别是当培养结果呈阴性或没有进行时.
• 组织病理学评估对于准确的解释和临床管理至关重要.