结合性转录基因和单细胞蛋白质对结直肠癌的表征描绘了与整体存活率相关的独特的瘤免疫微环境
Erika Hissong1, Bhavneet Bhinder2, Junbum Kim2
1Department of Pathology and Laboratory Medicine, Weill Cornell Medicine, 525 E 68th St, New York, NY 10065, USA; Englander Institute for Precision Medicine, Weill Cornell Medicine and New York Presbyterian, 413 E 69th St, New York, NY 10021, USA.
结直肠癌 (CRC) 中的瘤免疫微环境 (TIME) 显著影响患者的治疗结果. 一个由特定的免疫细胞和结构特征的激活的TIME与CRC患者的生存率改善有关.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 大肠直肠癌 (CRC) 呈现出显著的异质性,影响治疗反应和患者的预后.
- 瘤免疫微环境 (TIME) 越来越被认为是CRC进展和治疗疗效的关键因素.
研究的目的:
- 通过使用先进的分子和空间生物学技术,全面评估结直肠癌患者的TIME.
- 确定TIME内的特定免疫细胞组成与CRC患者预后之间的相关性.
主要方法:
- 使用整体外因子测序和大量RNA测序对原发性和转移性CRC样本进行分析.
- 使用了免疫细胞解,基因组丰富分析和无监督聚类.
- 在单细胞分辨率下对TIME组成进行了现场空间分析,使用成像质细胞计.
主要成果:
- 确定了两个不同的TIME表型:一种免疫激活表型和一种免疫抑制表型.
- 激活的TIME的特征是Th1细胞增加,激活的树突细胞,三级淋巴体结构和CD8+T细胞.
- 抑制的TIME显示M2巨细胞增加,并且非活化与激活的树突状细胞的比例更高,与较低的整体存活率相关 (HR1.66,p=0.007).
结论:
- 在结直肠癌中存在不同的免疫性TIME概况.
- 激活的TIME与CRC患者的生存率改善有关.
- 了解CRC TIME的分子驱动因素可能会导致新的治疗策略,以改善患者的治疗结果.
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