作为超增强体标志物BRD4的潜在陷的G-四重复合体:在体外对联体敏感的结合和共同分离
Iuliia I Pavlova1, Olga M Ivanova1,2, Mikhail S Iudin1
1Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine, Malaya Pirogovskaya, 1a, 119435 Moscow, Russia.
Nucleic acids research
|July 31, 2025
概括
在超增强体 (SE) 中的G四复合体 (G4s) 排除了核体,但保留了BRD4,这表明基因组独立的招募. G4配体破坏了SE促进体的通信,影响了基因调节.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 分子生物学分子生物学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- G四重复体 (G4s) 是在促进体和超增强体 (SE) 中发现的DNA结构.
- G4s排除了核细胞和招募转录因子.
- BRD4是SEs的关键标记物,通常结合乙化组织素,通过相分离促进SE-促进体接触.
研究的目的:
- 调查G4s的核细胞排除是否影响SEs的BRD4招募.
- 探索在富含G4的SEs.中维护基因组素独立的BRD4的机制.
- 确定G4配体对SE促进体通信和基因调节的影响.
主要方法:
- 对G4密度,核细胞占用率和SEs的BRD4结合的全基因组数据的分析.
- 在体外实验中评估G4与核细胞和BRD4原体的相互作用.
- 用BRD4在G4s,乙化核细胞和JQ1.1的存在下进行相分离测试.
- 用G4配体进行治疗,以评估对基因表达的影响.
主要成果:
- 具有高G4密度的SEs显示核缩,但保持了BRD4水平.
- 在实验室中,G4s 破坏了核细胞的稳定,并显示对BRD4 原体的结合较弱.
- G4s促进了BRD4相分离,类似于乙化核酶体,独立于JQ1.1.
- G4配体减弱了G4介导的相分离,并降低了由G4丰富的SEs调节的基因.
结论:
- 富含G4的SE是重要的转录调节器.
- BRD4可以保持在G4丰富的SE中,而不依赖于组织蛋白.
- G4配体可以破坏SE-促进器的通信,提供一种潜在的治疗策略.
