关于Clostridium isatidis BK32的完整基因组序列数据,该细菌是一种从堆肥中分离出来的降解纤维素菌
Pichpunleu Born1,2, Ayaka Uke1, Akihiko Kosugi1,2
1Biological Resources and Post-Harvest Division, Japan International Research Center for Agricultural Sciences (JIRCAS), 1-1 Ohwashi, Tsukuba, Ibaraki 305-8686, Japan.
Data in brief
|August 1, 2025
概括
测序了破坏米的细菌 *Clostridium isatidis* BK32 的基因组. 这种细菌显示出对纤维蛋白糖糖化 (lignocellulose saccharification) 的潜力,这是生物燃料生产的关键过程.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- *Clostridium isatidis* 是一种无氧,热爱菌的细菌.
- 与类型菌株相比,BK32菌株表现出较强的米草降解.
- 堆肥环境是具有工业潜力的新型微生物的来源.
研究的目的:
- 为了呈现 *Clostridium isatidis* BK32.2. 的完整基因组序列.
- 为了识别与林氏纤维素降解有关的基因和途径.
- 评估 *C. isatidis* BK32 在基纤维素糖化中的潜力.
主要方法:
- 使用PacBio单分子实时 (SMRT) 技术进行全基因组测序.
- 基因组的新组装. 基因组的新组装.
- 生物信息分析包括基因注释和碳水化合物活性酶 (CAZyme) 分析.
主要成果:
- 获得了一个单个圆形染色体的完整基因组序列 (2,978,451 bp, 29.1% GC含量).
- 该基因组包含2769个蛋白质编码基因和113个RNA基因.
- 鉴定出了320个参与碳水化合物代谢的基因和各种纤维细胞分解酶.
- 菌株BK32降解了80%以上的米.
结论:
- *C. isatidis* BK32的基因组序列为其基细胞细胞分解能力提供了宝贵的见解.
- 鉴定到的基因和酶突出显示了这种菌株在工业应用中的潜力,包括在纤维素酸糖化和生物燃料生产中.
- 完整的基因组序列在NCBI中以加入号 CP182825 作为公开可用.
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