巴基斯坦家族乳腺癌患者使用多基因面板测试的遗传景观
Muhammad Usman Rashid1, Noor Muhammad1, Shumaila Arif1
1Basic Sciences Research, Shaukat Khanum Memorial Cancer Hospital and Research Centre (SKMCH&RC), Lahore, Pakistan.
International journal of cancer
|August 1, 2025
概括
乳腺癌基因的致病变体在巴基斯坦家庭中很常见. BRCA1和BRCA2基因是主要原因,这表明巴基斯坦有针对性的基因测试小组.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 遗传性乳腺癌基因中的致病性/可能致病性 (P/LP) 变异解释了大约一半的家族病例.
- 关于巴基斯坦家族乳腺癌 (BC) 患者中超出BRCA1/2的P/LP变异的数据有限.
研究的目的:
- 通过使用14基因遗传性乳腺和卵巢癌 (HBOC) 面板,调查巴基斯坦家族BC患者中P/LP变异的频率和分布.
- 在巴基斯坦确定一个具有成本效益的基因测试策略的关键基因.
主要方法:
- 以传统方法对160名家族BC患者进行下一代测序 (NGS),对七个基因的蛋白质截断变异呈阴性.
- 使用桑格测序验证所有已识别的P/LP变体.
主要成果:
- 在七个基因中发现了24种独特的P/LP变异:BRCA1 (10),BRCA2 (6),TP53 (3),CHEK2 (2),PALB2 (1),ATM (1) 和RAD51C (1).
- 在18.1%的患者中,NGS检测到P/LP变体.
- 包括先前测试在内的总体检测率达到50.2%,其中BRCA1/2变异占所有P/LP变异的93.2%.
结论:
- 在家族BC中的P/LP变体集中在少数基因中,主要是BRCA1/2.2.
- 一个具有成本效益的,第一层基因测试小组为巴基斯坦家族BC风险评估应包括ATM,BRCA1,BRCA2,CHEK2,RAD51C,PALB2和TP53.
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