在便样本中检测肠道原生动物的商业和"内部"分子测试的比较分析

科学领域:

• 医学寄生虫学 医学寄生虫学
• 分子诊断学 分子诊断
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 肠道原生动物感染影响全球35亿人,导致严重的腹疾病.
• 目前对原生动物的显微镜诊断在灵敏度,特异性和物种差异化方面是有限的.
• 像实时PCR (RT-PCR) 这样的分子方法提供了更高的灵敏度和特异性,但面临技术挑战.

研究的目的:

• 为了比较商业RT-PCR测定 (AusDiagnostics) 和内部RT-PCR测定与显微镜.
• 评估用于检测Giardia duodenalis,Cryptosporidium spp.,Entamoeba histolytica和Dientamoeba fragilis的分子方法的性能.

主要方法:

• 一项涉及18个意大利实验室的多中心研究.
• 分析了355个便样本 (230个新鲜,125个保存).
• 澳大利亚诊断的RT-PCR,内部RT-PCR和显微镜的比较.

主要成果:

• 对于检测Giardia duodenalis的PCR方法之间完全一致,具有高灵敏度和特异性.
• 对Cryptosporidium spp.具有高特异性,但敏感性有限. 和Dientamoeba fragilis的检测,可能是由于DNA提取问题.
• PCR测定对于准确的Entamoeba histolytica诊断至关重要;保存样本比新鲜样本产生更好的PCR结果.

结论:

• 分子检测显示出对诊断肠道原生虫感染的希望,特别是对Giardia duodenalis和Cryptosporidium spp. 在固定标本中.
• 在分子方法中检测Dientamoeba fragilis的结果不一致.
• 样本采集,储存和DNA提取的标准化对于基于PCR的寄生虫识别一致和可靠至关重要.