对单细胞和批量转录基因数据的综合分析揭示了异位子宫内膜异位症中细胞组成和预测细胞类型的改变
Meihong Chen1,2, Liqun Wang2, Yuanting Chen2
1Department of Obstetrics and Gynecology, The Second Affiliated Hospital, Jiangxi Medical College, Nanchang University, Nanchang, China.
Frontiers in medicine
|August 4, 2025
概括
通过识别MUC5B+上皮细胞和dStromal-late介质细胞,改善子宫内膜异位症的诊断. 这些细胞驱动纤维化和炎症,MUC5B+上皮细胞具有很高的诊断潜力.
科学领域:
- 生殖生物学 生殖生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 子宫内膜异位症的诊断往往是延迟的,这带来了重大的临床挑战.
- 了解细胞组成对于子宫内膜异位症的诊断和治疗至关重要.
研究的目的:
- 综合调查子宫内膜异位症的细胞分类和组成.
- 确定用于子宫内膜异位症诊断的关键细胞标记物,并了解疾病机制.
主要方法:
- 利用了基因表达综合 (GEO) 数据库和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 数据.
- 应用CIBERSORTx用于细胞亚型比例估计,并构建一个随机森林模型用于诊断.
- 在特定细胞类型中进行了关键标记基因的免疫组织化学验证.
主要成果:
- 在子宫内膜异位症中确定了5种主要细胞类型和52种亚型,MUC5B+上皮细胞,dStromal晚期介质细胞和M2巨细胞的比例发生变化.
- 发现了与上皮质-介质酶过渡 (EMT),细胞迁移和炎症相关的丰富途径.
- 使用随机森林模型实现了高诊断性能 (AUC=0.932),MUC5B+上皮细胞作为最高预测特征.
结论:
- MUC5B+上皮细胞和dStromal-late介质细胞被确定为纤维化和子宫内膜异位症炎症的关键驱动因素.
- MUC5B+上皮细胞显示出作为子宫内膜异位症的主要诊断标记物的显著潜力.
