结肠癌中非编码RNA AC002331.1 的铁亡相关风险模型:通过竞争性内源RNA网络分析进行构建
Jiahui Liu1, Chenning Zhang1, Bao Ma1
1Department of Clinical Research Center, Central Hospital, Shandong First Medical University, No. 105, Jiefang Road, Lixia District, Jinan City, 250013, Shandong Province, China.
Discover oncology
|August 5, 2025
概括
这项研究确定了lncRNA AC002331.1作为结肠癌的关键调节剂,开发了一种新的预后模型,将铁和肠道微生物群相互作用整合起来,以改善治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 微生物组研究 微生物组研究
背景情况:
- 结肠癌是全球主要的健康问题,死亡率高.
- 长非编码RNAs (lncRNAs),ferroptosis和肠道微生物群的失调与结肠癌有关.
- 与铁亡相关的基因模型和微生物群代谢物显示出在预后评估和疾病调节方面的潜力.
研究的目的:
- 为了研究lncRNA AC002331.1在结肠癌中的作用.
- 建立一个竞争的内源RNA (ceRNA) 网络,以lncRNA AC002331.1为中心,以及它与ferroptosis的关系.
- 开发和验证结肠癌的预后模型,包括lncRNA,ferroptosis和肠道微生物群的代谢物相互作用.
主要方法:
- 使用 GEO 数据集 (GSE97300) 选差异表达的 lncRNAs.
- 预测ceRNA网络,并与铁变的数据库 (miRcode,miRTarBase,FerrDb) 进行整合.
- 使用 GutMGene 对肠道微生物群代谢物-基因相互作用的分析.
- 使用TCGA数据和WEKA,使用Kaplan-Meier和ROC曲线分析构建和验证12基因预后模型.
主要成果:
- 发现LncRNA AC002331.1在结肠癌中被上调,与更好的整体存活率 (OS) 和无病存活率 (DFS) 相相关.
- 涉及AC002331.1的ceRNA网络调节了29个与ferroptosis相关的基因.
- 这种12基因的预后模型显示出分辨能力 (ROC AUC 0.653-0.683),并确定了由微生物群代谢物,如酸盐等共同调节的基因.
结论:
- 这项研究提出了第一个以lncRNA AC002331.1为中心的CeRNA-ferroptosis结肠癌预后模型.
- 这些发现突出了微生物群代谢物和结肠癌进展中的基因调节之间的相互作用.
- 这项研究为开发针对结肠癌的向治疗干预提供了新的机制性见解.
