在吉尔吉斯斯坦,使用metabarcoding对来自牛和绵羊的的真核病原体进行全国性调查

科学领域:

• 兽医昆虫学 兽医昆虫学
• 寄生虫学的寄生虫学
• 分子生态学分子生态学

背景情况:

• 会传播许多病原体,对公众健康和农业构成风险.
• 传播的疾病在吉尔吉斯斯坦越来越令人担忧,对原生动物病原体的数据有限.
• 吉尔吉斯斯坦的先前研究集中在特定的Babesia和Theileria物种上,在全面的全国数据中留下了一个空白.

研究的目的:

• 在吉尔吉斯斯坦从牛和绵羊中采集的虫中对原生动物病原体,特别是Babesia和Theileria进行全国性评估.
• 通过使用真核生物元编码来分析这些原生动物在属级的流行和分布.
• 建立基线数据,以了解区域牲畜中传播原生动物疾病的动态.

主要方法:

• 在吉尔吉斯斯坦七个地区 (2022年3月至7月) 收集了472只牛和羊的样.
• 使用显微镜和线粒体COI基因的桑格测序识别了物种.
• 分析了包括Babesia和Theileria在内的真核微生物群,使用18SrRNA V9下一代测序 (NGS).

主要成果:

• 确定了五个属和11种虫物种.
• 在属级检测到的最常见的原生动物是Babesia (13.3%) 和Theileria (12.7%).
• 贝贝西亚的流行率在和羊中较高,而Theileria在物种和宿主中分布更广泛.

结论:

• 这是吉尔吉斯斯坦第一个全国性的虫真核生物元编码研究,专注于基因级的致病原生动物.
• 这些发现提供了关于Babesia和Theileria的地理和宿主特异性流行率的关键基线数据.
• 了解原生动物的患病率对于制定有效的对畜牧业婴儿病和乳头病的监测和控制策略至关重要.