利用各种细胞死亡模式来预测肝细胞癌的预后和免疫治疗
Xiaoxiang Zhang1, Dongxiao Ding2, Dianqian Wang1
1Health Science Center, Ningbo University, Ningbo, 315800, Zhejiang, China.
Discover oncology
|August 6, 2025
概括
这项研究开发了一种新的9基因编程细胞死亡 (PCD) 签名,以预测肝肝细胞癌 (LIHC) 患者的预后和免疫治疗反应. 签名有效地分层风险,有助于LIHC个性化治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫治疗是一种免疫疗法.
背景情况:
- 肝肝细胞癌 (LIHC) 呈现出高发病率和快速进展,尽管有治疗努力,预后不佳.
- 编程细胞死亡 (PCD) 功能障碍与癌症进展和患者的结果有关.
- 开发LIHC准确的预后工具对于改善患者存活率至关重要.
研究的目的:
- 基于与编程细胞死亡 (PCD) 相关的基因,为LIHC患者构建一种新的预后特征.
- 评估签名预测预后和对LIHC免疫治疗的反应的能力.
- 在LIHC中确定潜在的生物标志物,用于风险分层和治疗选择.
主要方法:
- 从GSEA基因组中选了1249个PCD相关基因.
- 利用权重基因关联网络分析 (WGCNA) 来识别与生存相关的基因.
- 开发并验证了使用考克斯回归,LASSO和外部数据集 (ICGC-LIRI-JP,GSE14520) 的9基因预后签名.
- 使用ESTIMATE和ssGSEA算法评估免疫透和功能.
- 使用TIDE,IPS,免疫检查点和IC50值预测化学敏感性和免疫治疗反应.
- 使用GSE91061和PRJEB23709数据集验证的免疫治疗反应预测.
主要成果:
- 在1249个PCD相关基因中确定了89个与生存相关的基因.
- 构建了一个9基因的预后特征 (GLA,CLTA,CHGA,ERP29,MAPK3,CDK5,NLE1,STYXL1,SFN).
- 高风险LIHC患者的预后不佳;签名显示独立的预后价值.
- 低风险患者的免疫透率和检查点较高,表明对免疫疗法 (ICI) 的反应更好.
- 在验证队列中,ICI治疗的响应者表现出较低的风险得分.
结论:
- 开发了一种新的9基因PCD相关预后签名,用于LIHC.
- 该签名有效地根据风险对LIHC患者进行分层,并预测预后.
- 该签名显示了在LIHC患者中预测免疫治疗反应的潜力.
