使用生物层干涉测量的抗病毒化合物的表征
Zachary C Lorson1,2, William M McFadden1,2, Grace Neilsen1,2
1Center for ViroScience and Cure, Laboratory of Biochemical Pharmacology, Department of Pediatrics, Emory University School of Medicine, 1760 Haygood Drive NE, Atlanta, GA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|August 8, 2025
概括
优化的生物层干扰测量 (BLI) 协议有效地描述了用于抗病毒发现的小分子-蛋白相互作用. 这种高通量方法克服了常见的陷,使药物开发的精确亲和度测量成为可能.
科学领域:
- 生物化学和分子生物学
- 药物发现和开发 药物发现和开发
- 生物物理化学 生物物理化学
背景情况:
- 小分子-蛋白相互作用对于生物功能和疾病治疗至关重要.
- 生物层干涉测量 (BLI) 为研究这些相互作用提供了一种敏感,高通量的方法,特别是在抗病毒发现中.
- 诸如非特异性结合和带漂移等挑战可能会阻碍BLI的准确性.
研究的目的:
- 为描述小分子-蛋白相互作用提供优化的BLI协议.
- 解决和提供解决BLI常见陷的问题.
- 为了证明BLI在计算临床相关抗病毒化合物的结合 afinities 的实用性.
主要方法:
- 开发和应用优化的BLI协议.
- 描述PF74和HIV-1囊蛋白 (CA) 之间的相互作用.
- 对Lenacapavir (LEN) 与HIV-1 CA和Nirmatrelvir (NIR) 与SARS-CoV-2 Mpro.的分析
主要成果:
- 证明BLI是计算从微到亚纳米级范围的结合亲和力 (KD值) 的强大工具.
- 对HIV-1 CA与PF74和LEN的相互作用的量化结合亲缘关系.
- 证实了尼尔马特雷尔维尔和SARS-CoV-2 Mpro.之间的共价相互作用.
结论:
- 优化的BLI协议促进了小分子与蛋白质结合的准确表征.
- BLI有效地确定了抗病毒药物候选者的结合 afinities 和相互作用类型.
- 这些协议支持新型抗病毒药物和衍生品的高通量查和测试.


