在认知障碍和阿尔茨海默病中,可转移元素的表观遗传失调
Alyssa N Cavalier1,2, Meghan E Smith1,2, Gabriella T McWilliams1
1Department of Health and Exercise Science, Colorado State University, Fort Collins, CO, USA.
表观遗传变化,如DNA低甲基化,可能会在阿尔茨海默病 (AD) 中驱动可移植元素 (TE) 活性. 这项研究将TE失调与老化和AD患者的认知衰退和炎症联系在一起.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 神经科学是一个神经科学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 衰老和认知障碍是阿尔茨海默病 (AD) 的危险因素.
- 可转移元素 (TE) 越来越多地与衰老和AD病变产生有关.
- 在AD中TE失调的机制,可能涉及表观遗传变化,仍然不清楚.
研究的目的:
- 为研究老化和AD中的TE表观遗传学创建资源.
- 调查表观遗传失调的TE与老化和AD的临床结果之间的关系.
主要方法:
- 在健康的老年人,轻度认知障碍 (MCI) 和AD痴呆症患者的外周血液上进行RNA测序 (RNA-seq).
- 全基因组二硫酸盐测序 (WGBS) 用于评估DNA甲基化模式.
- 转化酶可访问的染色体测序 (ATAC-seq) 用于评估染色体的可访问性.
主要成果:
- 在MCI和AD患者中,TE转录表达显示出波动模式.
- 大多数失调的TE位于低甲基化和染色质可访问的基因组区域.
- 这些TEs与炎症,认知/功能状态,年龄和神经退行症的生物标志物有关.
结论:
- 表观遗传变化,包括DNA低甲基化和改变的染色质结构,可能有助于TE转录失调在衰老和AD.
- 失调的TE可能在认知衰退和阿尔茨海默病的病理生理学中发挥重要作用.
- 这些发现支持一种表观遗传变化影响TE活动的模型,影响衰老和神经退行性疾病.
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