综合性scATAC-seq和mtDNA突变分析揭示了AML中疾病驱动的调节性偏差
Chen Tian1, Yijun Dong2, Xin Sun3
1Tsinghua University School of Medicine, Beijing 100084, China; National Engineering Research Center of Eco-environment Protection for Yangtze River Economic Belt, China Three Gorges Corporation, Wuhan 430014, China.
Science bulletin
|August 8, 2025
概括
研究人员确定了关键的基因突变和调控变化,导致急性髓性白血病 (AML) 的进展和复发. 这项研究揭示了用于预测AML药物耐药性和患者结果的新生物标志物.
科学领域:
- 血液学 血液学 血液学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 血液形成中的转录失调会导致异常分化和白血病发生.
- 急性髓性白血病 (AML) 的复发率很高,因此需要更好地了解进展和预后生物标志物.
研究的目的:
- 使用先进的单细胞技术全面描述AML细胞.
- 在AML.中识别染色质可访问性和基因调控网络 (GRNs) 的变化.
- 发现用于预测AML复发和耐药性的新生物标志物.
主要方法:
- 线粒体单细胞测定转化酶可访问的染色质与测序 (mtscATAC-seq) 结合单细胞RNA-seq.
- 构建用于瘤细胞分析的单细胞血液形成参考图.
- 开发和应用cisGRN算法用于CRE动态分析.
- 线粒体DNA追踪和机器学习用于识别复发相关的克隆.
主要成果:
- 鉴定了与AML分化相关的cis-regulatory元素 (CREs) 中显著的染色质可访问性改变.
- 发现的致病性WT1指突变降低了染色质的可访问性,并降低了目标基因的调节.
- 发现了早期的造血CRE突变,激活CEBPB和GATA4,促进AML的扩散.
- 确定了与复发相关的克隆 (类似于白血病干细胞) 和预测耐药性和复发风险的标记基因.
结论:
- 结合mtscATAC-seq,血统追踪和GRN分析,可以有效地发现AML中异常的监管变化.
- WT1突变和特定的CRE变异是AML病原和进展的关键驱动因素.
- 从易复发的克隆中获得的新型生物标志物可以改善对抗药性和AML患者结果的预测.
