口腔状细胞癌的多模式分析识别了与贝特尔咬相关的基因组变化和表达程序
Shih-Chi Su1, Chiao-Wen Lin2, Mu-Kuan Chen3
1Whole-Genome Research Core Laboratory of Human Diseases, Chang Gung Memorial Hospital, Keelung, 204, Taiwan; Department of Medical Biotechnology and Laboratory Science, College of Medicine, Chang Gung University, Taoyuan, 333, Taiwan.
Neoplasia (New York, N.Y.)
|August 10, 2025
概括
贝特尔可以显著改变口腔癌的基因组和瘤微环境. 这些基因组和细胞变化表明,与贝特尔相关的口腔状细胞癌是一种独特的亚型.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 癌症生物学 癌症生物学
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 在东南亚,贝特尔 (BQ) 是口腔状细胞癌 (OSCC) 的主要危险因素.
- 将BQ使用与OSCC发展联系在一起的精确机制,包括基因组损伤和瘤微环境变化,仍然不完全理解.
研究的目的:
- 阐明与BQ相关的OSCC的多omics景观和瘤微环境.
- 为了识别受BQ影响的特定基因组变化,瘤性途径和细胞间通信网络.
主要方法:
- 多omics分析包括261名OSCC患者 (BQ者和非使用者) 瘤-正常对的外体序列测序.
- 集成的单细胞和空间转录组学来分析瘤微环境.
- 进行比较基因组和转录基因组分析以确定BQ特异性变化.
主要成果:
- BQ与明显的基因组变化有关,包括TP53和CHUK的突变,以及MAP3K13,FADD和CDKN2A.A.的副本数量变化.
- 与BQ相关的OSCC表现出改变的瘤微环境,诱导缺氧,树突细胞的免疫抑制和血管生成的增加.
- 定量通信预测显示,在与BQ相关的OSCC中,细胞-细胞交叉更加异质,特别是涉及纤维细胞和树突细胞.
结论:
- 在OSCC中,BQ会诱导独特的基因组特征和瘤微环境.
- 这些发现表明,与BQ阴性OSCC相比,与BQ相关的OSCC可能代表一个不同的病因亚型.
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