与T细胞相关的诊断模型和与败血症中PRF1-介导的糖解相关的潜在机制:来自单细胞,批量转录组学和实验验证的证据
Fu Tian1, Hui Chen1, Zhicheng Huang1
1Department of Intensive Care Unit, Hangzhou Geriatric Hospital, No. 50 Jingshen Road, Gongshu, Hangzhou, 310022, Zhejiang, China.
European journal of medical research
|August 10, 2025
概括
使用T细胞的15基因诊断模型有效地预测了败血症. 基因PRF1是一种关键指标和治疗标,主要在糖解中起作用.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 代谢途径 代谢途径
背景情况:
- 败血症是一种危及生命的全身性炎症反应.
- T细胞,特别是CD8+ T细胞,在败血症的发病过程中起着至关重要的作用.
- 识别可靠的诊断标志物和理解机制对于败血症管理至关重要.
研究的目的:
- 开发一种基于T细胞的败血症诊断模型.
- 阐明涉及T细胞的败血症的潜在分子机制.
- 研究PRF1在败血症中的作用及其作为治疗点的潜力.
主要方法:
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和RNA-seq数据分析.
- 生物信息学方法包括PCA,LASSO用于基因选择.
- 一个15基因诊断模型的构建和ROC曲线验证.
- GO和KEGG的路径丰富分析.
- 代谢流量分析和体内/体外败血症模型 (CLP和LPS).
主要成果:
- 建立了15基因T细胞相关的毒症诊断特征.
- 鉴定出PRF1基因在T细胞中表达高,与糖解有关.
- 在败血症模型中,PRF1,炎症标志物 (TNF-α,IL-1β),乳酸和糖解标志物 (PFKFB3,PKM2,GLUT1) 升高.
- 抑制PRF1降低了炎症标记物,乳酸和糖解标记物.
结论:
- 一种基于15基因T细胞的新型败血症诊断模型证明了预测功效.
- PRF1是败血症的一个重要指标和潜在的治疗点.
- 在败血症中,PRF1的主要功能是调节糖解.
