将基于NUPACK的模拟纳入课堂和实验室教学中,用于本科生化学的核酸混合化

科学领域:

• 生物化学教育教育 生物化学教育
• 计算生物学 计算生物学
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 随着COVID-19的流行,人们不得不转向远程学习,这凸显了对可适应的教育平台的需求.
• 传统的"湿实验室"活动在偏远环境中带来了挑战,需要创新的虚拟替代方案.
• 可访问和灵活的学习环境对于科学教育中的各种学生需求至关重要.

研究的目的:

• 使用NUPACK生物化学网络应用程序开发和描述关于核酸的教育模块.
• 创建一个虚拟的"干实验室"体验,补充讲座,并增强对核酸性质的理解.
• 为生物化学和分子生物学的教育工作者和学生提供灵活和可访问的学习工具.

主要方法:

• 利用NUPACK,一个免费的基于云的Web应用程序,来设计用于核酸教育的计算模块.
• 开发了包括融化温度,杂交平衡,自由能量和二次结构等主题的模块.
• 为生物化学讲座和实验室实施了计算机辅助的DNA实验,包括向高中生推广.

主要成果:

• 成功创建了基于NUPACK的教育模块,用于教导基本的核酸概念.
• 计算实验室提供了实践式的学习体验,提高了学生对核酸结构和杂交的理解.
• 在疫情期间成功过渡到远程学习,保持教育连续性.
• 扩展了计算DNA实验以吸引当地高中生,扩大了可访问性.

结论:

• 基于NUPACK的计算实验室提供了一种有效和可适应的方法,用于在生物化学中教授核酸.
• 虚拟"干实验室"练习提高了学生的理解,并为远程和面对面的学习提供了灵活性.
• 这种方法支持创新的在线教学方法,并为各种学习者扩大了对分子生物学教育的访问.