对比的基因组分析揭示了Maloideae两种水果的不同遗传基础
Yi Wang1,2, Hongju Hu3, Juntong Jin1
1Key Laboratory of Fruit Postharvest Biology (Liaoning Province), College of Horticulture, Shenyang Agricultural University, Shenyang, China.
两个长非编码RNAs,乙烯抑制因子1 (EIF1) 和EIF2,通过抑制乙烯生产来控制水果成熟. 它们在梨中的缺席导致了依赖乙烯的成熟,而它们的存在导致了依赖乙烯的成熟.
科学领域:
- 植物生物学 植物生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 果实成熟 果实成熟
背景情况:
- 果实成熟被分为依赖乙烯和依赖乙烯的类型,但潜在的机制仍然不清楚.
- 梨子 (Pyrus spp.) 种类:梨子 (Pyrus spp.) 种类:梨子 (Pyrus spp.) 种类:梨子 种类:梨子 它们表现出两种成熟类型,使它们成为研究这种现象的理想模型.
研究的目的:
- 阐明区分乙烯依赖和乙烯独立果实成熟的遗传机制.
- 确定在水果成熟期间调节乙烯生物合成的关键遗传因素.
主要方法:
- 组装的哈普洛型解析,染色体层次的基因组为梨加入.
- 118个梨子加入的重新排序.
- 进行比较基因组分析以确定结构变异和非编码RNA.
主要成果:
- 鉴定了两个长非编码RNAs,乙烯抑制因子1 (EIF1) 和EIF2,可以抑制乙烯生物合成基因ACS1.1.
- 由于异位基因特异性的结构变异,EIF1和/或EIF2的损失导致依赖乙烯的成熟.
- 在以乙烯独立的水果 (梨,) 中存在并转录EIF同类物,但在以乙烯独立的水果 (果,棘) 中不存在.
结论:
- EIF1和EIF2是赋予以乙烯独立果实成熟的关键调节者.
- 导致EIF丧失的基因组结构变异是导致肉质水果依赖乙烯成熟的原因.
- 了解这些机制为Maloideae物种的水果发育和成熟提供了洞察力.
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