寄生虫种群动态形状和删除模式在秘鲁亚马逊
Erick Figueroa-Ildefonso1, Luis Cabrera-Sosa2, Johanna H Kattenberg3
1Laboratorio de Malaria: Parasitos y Vectores, Laboratorios de Investigación y Desarrollo, Facultad de Ciencias e Ingeniería, Universidad Peruana Cayetano Heredia.
Research square
|August 13, 2025
概括
在秘鲁,Plasmodium falciparum pfhrp2/3基因的删除正在增加,这可能是由于遗传漂移和人口瓶,而不是积极选择. 这影响了疟疾快速诊断测试 (RDTs).
科学领域:
- 基因组学和寄生虫学
- 进化生物学 进化生物学
- 疟疾的诊断 疟疾的诊断
背景情况:
- 自2012年以来,秘鲁亚马逊地区的pfhrp2和pfhrp3基因缺失的Plasmodium falciparum寄生虫的患病率增加.
- 这些基因缺失与快速诊断测试 (RDT) 的失败有关.
- 这种现象的进化驱动因素不清楚,因为基于HRP2的RDTs在该地区没有广泛使用.
研究的目的:
- 描述2006年至2018年间秘鲁P. falciparum种群的情况.
- 为了确定基因组区域,展示最近积极选择的证据.
- 了解驱动具有pfhrp2/3删除的寄生虫占主导地位的进化因素.
主要方法:
- 来自洛雷托地区的159个P. falciparum样本的PCR基因定型.
- 42个PCR基因型样本的全基因组测序 (WGS),与60个现有的基因组数据集成.
- 对人口结构复杂性的分析和积极选择信号的识别.
主要成果:
- 60%的样本显示了双 pfhrp2/3 删除,22%没有删除,16%有一个单一的 pfhrp2 删除.
- 从2006-2011年到2012-2018年,寄生虫种群结构复杂性的显著减少,这表明出现了瓶事件.
- 没有证据表明pfhrp2/3基因的积极选择;观察到的扩张归因于遗传漂移.
结论:
- pfhrp2/3删除的传播很可能是由遗传漂移和人口瓶驱动的,而不是积极选择.
- 观察到的表型 (RDT逃避) 的演变不同于积极选择力预期的.
- 倡导使用非向基因组方法的持续监测,如WGS来监测影响疟疾控制的适应.
