使用机器人自动化 (RoboCTAB) 进行高吞吐量DNA提取,用于大规模的基因定型
Vincent-Thomas Boucher St-Amour1, Vipin Tomar1, François Belzile1,2
1Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Quebec City, QC G1V 0A6, Canada.
Plants (Basel, Switzerland)
|August 14, 2025
概括
我们开发了RoboCTAB,一种半自动化DNA提取方法,使用负担得起的机器人技术进行大规模的植物基因定型. 这种低成本,高吞吐量系统提供高效和高质量的DNA提取,适合各种下游应用.
科学领域:
- 农业科学 农业科学
- 生物技术是生物技术.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 传统的手动DNA提取方法用于植物基因定型是劳动密集型的,容易出现错误,并且昂贵.
- 手工工艺的局限性阻碍了对基因分析进行高效,大规模的DNA提取.
研究的目的:
- 介绍RoboCTAB,一个半自动化,机器人辅助的DNA提取系统,用于可扩展的植物基因型.
- 适应CTAB协议用于机器人液体处理,确保与高吞吐量基因类型的兼容性.
- 在规模上评估不同植物组织的DNA提取效率和质量.
主要方法:
- 开发了一种半自动化DNA提取协议 (RoboCTAB),使用负担得起的液体处理机器人.
- 调整了CTAB协议用于机器人集成,并测试了各种植物组织 (叶子,根,种子芯片).
- 评估DNA产量,质量,成本效益和处理能力 (每批最多384个样本).
主要成果:
- 年轻的根 (根基) 是最容易在规模上收获的植物组织,用于DNA提取.
- 叶子和根的DNA产量和质量足以用于下游应用;种子芯片不适合.
- RoboCTAB展示了显著的劳动力成本节约,高质量的DNA输出,并将交叉污染风险降到最低.
- 该系统可以同时处理多达384个样本,提高了成本效益.
结论:
- RoboCTAB提供了一个可扩展,可靠和可访问的解决方案,用于高吞吐量植物DNA提取和基因造型.
- 这种半自动化系统为高度复杂,昂贵的平台提供了负担得起的替代方案.
- RoboCTAB简化了实验室的工作流程,提高了大规模DNA处理和测序的效率和质量.
