在常规分子诊断中通过准NGS面板对微卫星不稳定检测的现实世界评估
Petra Škerl1,2, Vesna Vogrič1, Vida Stegel1,3
1Department of Molecular Diagnostics, Institute of Oncology Ljubljana, Zaloška 2, 1000 Ljubljana, Slovenia.
International journal of molecular sciences
|August 14, 2025
概括
下一代测序 (NGS) 准确检测瘤中的微卫星不稳定性 (MSI),有助于预测免疫检查点抑制剂反应. 建议的切断点为13.8%的MSI得分,并将TMB整合到边界病例中.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子诊断学 分子诊断学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 微卫星不稳定性 (MSI) 是预测免疫检查点抑制剂 (ICI) 治疗反应和识别林奇综合征的关键生物标志物.
- 缺乏使用下一代测序 (NGS) 检测MSI的标准化值,使临床解释复杂化.
研究的目的:
- 为了评估Illumina的TruSight瘤170和TruSight瘤500针对MSI检测的NGS面板的性能.
- 为了比较基于NGS的MSI结果与MSI-聚合酶连锁反应 (MSI-PCR) 基准方法在多样化的患者队列中.
主要方法:
- 追溯分析331名癌症患者的样本.
- 通过Illumina NGS面板生成的MSI得分与MSI-PCR进行比较.
- 使用曲线下的面积 (AUC) 度量来评估一致性,灵敏度和特异性.
主要成果:
- 在NGS和MSI-PCR之间具有很高的整体一致性 (AUC = 0.922).
- 由于得分的变化,结直肠癌的敏感性较低 (AUC = 0.867).
- 建议的MSI分数切断值为MSI-High (MSI-H) 识别的≥13.8%,边界范围 (≥8.7%至<13.8%) 受益于TMB集成.
结论:
- 伊卢米纳的NGS面板证明了MSI-H瘤识别的临床实用性.
- 结合MSI和瘤突变负担 (TMB) 的方法可以提高边界病例的诊断准确性.
- 对于不确定的结果,建议使用MSI-PCR进行正交确认,以确保精确的MSI分类.
