通过液体活检剖析瘤异质性 - - 在固体瘤中对死后组织和死前液体活检进行比较分析

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 瘤异质性,包括遗传,表观遗传和表型多样性,显著影响癌症治疗反应和耐药性.
• 空间和时间的异质性分别来自于伤口间和伤口内变异和克隆进化.
• 传统的组织活检往往无法捕捉瘤遗传多样性的全谱.

研究的目的:

• 评估液体活检 (LBx) 在捕获瘤异质性的能力.
• 为了比较从多种转移性病变和LBx样本中获得的遗传特征.
• 评估组织和LBx衍生的遗传信息之间的一致性和不一致性.

主要方法:

• 分析了来自八名癌症患者的56个死后组织样本.
• 与通过下一代测序 (NGS) 分析的死前LBx衍生循环自由DNA (ctDNA) 的比较.
• 组织和LBx之间的详细的突变分析和变异性等位基因频率 (VAF) 比较.

主要成果:

• 组织分析显示,每名患者的4-12个突变具有显著的内部和间损伤异质性.
• 在每位患者中,LBx发现了4至17种变异,其中33至92%与组织突变重叠.
• 发现了大量的组织特异性 (22) 和LBx专属 (18) 变异,突出了补充信息.

结论:

• 液体活检有效捕捉瘤异质性的方面.
• LBx提供实时洞察瘤进化,并可以检测耐药性突变.
• 综合性基因分析需要结合使用LBx和组织活检.