扫描-ACT:通过单细胞转录组学通过采用T细胞治疗的目标发现

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 基因组学就是基因组学.
• 计算生物学 计算生物学

背景情况:

• 采用T细胞疗法 (ACT) 对固体瘤有前途,但确定适合瘤特异性标是具有挑战性的.
• 罕见的癌症亚型尤其缺乏对T细胞受体工程T细胞 (TCR-T) 和仿真抗原受体 (CAR) -T细胞的明确目标.

研究的目的:

• 开发一个计算管道 (SCAN-ACT) 用于在固体瘤中提名和优先考虑ACT的目标.
• 为了能够分别识别CAR-T和TCR-T细胞疗法的表面膜和-MHC标.

主要方法:

• SCAN-ACT利用来自瘤和正常组织的单细胞RNA测序和多组数据.
• 它为CAR-T细胞指定单特异性和双特异性标,为TCR-T细胞指定类MHC标.
• 对选定目标进行了蛋白质表达和-MHC结合的实验验证.

主要成果:

• 应用到软组织肉瘤 (STS),SCAN-ACT确定了395个单种CAR-T标,14,192个双种CAR-T标和5020个-MHC标.
• 确定的目标反映了STS.内的多样化的细胞起源.
• 管道的多功能性进一步通过其用于质母细胞瘤的应用来证明.

结论:

• SCAN-ACT提供了一个强大的数据库和用户友好的网络工具,以推进对固体瘤的ACT开发.
• 该资源旨在加快对具有挑战性的癌症类型的新疗法点的发现.