在阿拉伯半岛的以色列贝都因人祖先中,自体逆性多囊性病的内部和编码遗传变异
Nadav Agam1, Ohad Wormser1, Ari Biller1
1The Morris Kahn Laboratory of Human Genetics, National Institute of Biotechnology in the Negev, Ben Gurion University of the Negev, Be'er Sheva, Israel; Faculty of Health Sciences, Ben-Gurion University of the Negev, Be'er Sheva, Israel.
在以色列贝都因家庭中发现了一种新型的深内基PKHD1突变,导致自体逆性多囊性病 (ARPKD). 全基因组测序揭示了一种创始突变,导致异常拼接和过早停止密码子,改善ARPKD诊断.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 分子生物学分子生物学
- 儿科脏病学 儿科脏病学
背景情况:
- 自体逆性多囊性病 (ARPKD) 是一种严重的遗传疾病,通常是由PKHD1突变引起的.
- 一部分ARPKD患者缺乏分子诊断,这表明存在神秘或非编码变体.
- 识别新的遗传变异对于准确诊断和了解疾病机制至关重要.
研究的目的:
- 在缺乏分子诊断的以色列贝都因ARPKD患者中识别神秘的致病变体.
- 调查ARPKD在特定,代表性不足的人群中的遗传基础.
- 评估全基因组测序 (WGS) 在诊断复杂遗传疾病中的实用性.
主要方法:
- 采用病例序列方法,专注于来自五个与ARPKD无关家庭的12名贝都因患者.
- 使用短读和长读平台进行全基因组测序 (WGS).
- 生物信息学过,转录分析和功能研究被用来证实变体的致病性.
主要成果:
- 一种深入的PKHD1变体 (c.8643-2945 G>A) 被确定为五个家庭的12名ARPKD患者的共同创始基因突变.
- 这种变体通过伪外显子的包含引起了异常拼接,导致过早停止密码子和截断的PKHD1蛋白.
- 鉴定的突变存在于2%的种族匹配对照组中,表明携带者率为1:50.
结论:
- 一个创始人深内基PKHD1突变是阿拉伯半岛祖先的以色列贝都因人ARPKD的重要原因.
- 突变通过捐赠者增益拼接机制起作用,突出显示了ARPKD中非编码变异的重要性.
- 与转录分析相结合的WGS是诊断ARPKD的强大工具,特别是在无法解释的遗传发现的情况下.
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