从人类的Caco-2和HepG2细胞中获得的6PPD-基的转录基因起点
Ke Xu1, Krittika Mittal1, Niladri Basu1
1Faculty of Agricultural and Environmental Sciences, McGill University, Montreal, Quebec, Canada.
概括
环境污染物6ppd-金显示出对人类健康的潜在影响. 这项研究使用TPD-seq在人体细胞中建立转录组起点 (tPOD),为风险评估提供定量数据.
科学领域:
- 环境毒理学环境毒理学
- 人类健康风险评估
- 文字转录学 (Transcriptomics) 是一个学科.
背景情况:
- 在环境和人类生物流体中越来越多地检测到N-(1,3-Dimethyl butyl) -N'-phenyl-phenylenediamine-quinone (6ppd-quinone).
- 关于6ppd-金对人体组织的毒理影响的数据有限.
- 了解6ppd的作用对于人类健康风险评估至关重要.
研究的目的:
- 为了研究6ppd-金对人类健康的潜在影响.
- 在人类细胞系中导出转录组起点 (tPOD) 值.
- 评估TPD-seq的工作流程用于定量和机械数据生成.
主要方法:
- 在两个人类细胞系 (Caco-2和HepG2) 上利用TPD-seq工作流.
- 在非细胞毒性条件下为细胞毒性和tPOD值计算的EC20.
- 采用多种统计和生物信息方法进行数据分析,包括各种映射方法,算法和过器.
主要成果:
- 对Caco-2细胞 (104μg/L) 确定了细胞毒性EC20,但没有确定HepG2.2.
- 对于Caco-2 (6.525μg/L) 和 HepG2 (0.3635μg/L) 细胞,tPOD值均成功得出.
- 确定了受6ppd-影响的关键基因和通路,并计算了两个细胞系中特定基因和通路的基准剂量 (BMD).
结论:
- TPD-seq是一个有效的工作流程,用于生成化学物质暴露的定量和机械数据.
- 这项研究为6ppd-金提供了有价值的tPOD和BMD值,有助于评估人类健康风险.
- 这些发现强调,需要进一步研究6ppd暴露对人类健康的影响.
