使用多分片分析探索SARS-CoV-2的尖端糖蛋白编码基因:揭示病毒传播的结构复杂性和影响
J P Correia1, M E P L Dantas2, J M G Araújo2
1Departamento de Física, Federal University of Rio Grande do Norte, Natal, RN, 59072-970, Brazil.
Computers in biology and medicine
|August 17, 2025
概括
先进的计算分析揭示了SARS-CoV-2尖端蛋白在各个变体中的复杂碎形模式. 德尔塔和Omicron变种显示出最高的复杂性,为病毒进化和适应提供了洞察力.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 计算生物学 计算生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- SARS-CoV-2 的 Spike 蛋白对于病毒感染性和免疫反应至关重要.
- 了解斯派克基因的基因组区域对于跟踪病毒进化,疫苗开发和治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 为了研究SARS-CoV-2尖端蛋白在德尔塔,玛,奥米克朗和泽塔变种中的扩展性质和多分体复杂性.
- 通过使用先进的计算方法,识别每个变体的独特分形符号.
主要方法:
- 多分形确定波动分析 (MFDFA)
- 复杂性- (CE) 平面分析.
- 混沌游戏表示 (CGR)
主要成果:
- 在Spike蛋白序列中观察到复杂的多分离模式和长距离相关性.
- 德尔塔和欧米克朗变种显示出最高的多分形复杂性,表明更大的序列异质性.
- 特定的参数 (Δh, Δα, B) 有效地区分了每个变体的碎形签名.
结论:
- 尖端蛋白的序列复杂性影响SARS-CoV-2的适应和演变.
- 不同的碎形签名为变体之间的基因组架构差异提供了洞察力.
- 这些发现增强了我们对病毒动态的理解,并为未来对SARS-CoV-2的研究提供了信息.


