一个多重目标NGS面板用于识别犬神经和生殖疾病中的病原体

科学领域:

• 兽医微生物学 兽医微生物学
• 狗的传染病 狗的传染病
• 分子诊断学 分子诊断

背景情况:

• 狗的生殖和中枢神经系统易受各种病原体的感染,其中一些是动物感染的.
• 准确有效地识别这些病原体对于狗的健康和公共安全至关重要.

研究的目的:

• 开发和验证一个有针对性的下一代测序 (tNGS) 面板,用于同时检测常见的和动物感染的犬病原体.
• 评估开发的tNGS试验的诊断性能和可重复性.

主要方法:

• 开发原料池来检测34种病原体,使用多重PCR和离子流测序.
• 使用尖端临床样本,细菌分离物和合成DNA (gBlocks) 进行可行性测试.
• 使用76只狗神经和生殖样本进行验证,将结果与实时PCR进行比较.

主要成果:

• tNGS小组成功检测出34种向生物中的33种.
• 实现了89%的诊断灵敏度和98%的特异性.
• 证明了高复制性 (科恩的卡帕=0.77) 并为犬病毒和犬病毒-2.2提供了菌株类型.

结论:

• 开发的tNGS测定是一种全面的工具,用于对犬类传染病原体的综合征测试.
• 虽然比实时PCR敏感度略低,但其广泛的病原体检测能力是有利的.
• 该测试提供了一种可靠的方法,用于识别狗样本中的多种传染病原体.